INTERAKSI PROTEIN-ASAM NUKLEAT: MEKANISME PENGENALAN SPESIFIK PADA REGULASI GEN

Abstract

Interaksi spesifik antara protein dan asam nukleat merupakan fondasi dari berbagai proses biologis esensial, termasuk replikasi, transkripsi, dan translasi gen. Meskipun banyak struktur telah dipecahkan, mekanisme molekuler di balik pengenalan sekuens spesifik oleh protein pengikat DNA atau RNA masih menjadi area penelitian yang aktif. Studi ini bertujuan untuk mengelusidasi detail atomik dari pengenalan sekuens tertentu oleh protein regulator kunci yang terlibat dalam ekspresi gen. Menggunakan kombinasi kristalografi sinar-X, kriomikroskopi elektron, dan mutasi situs-spesifik, kami menganalisis kompleks protein-asam nukleat dan mengidentifikasi residu asam amino kunci yang berinteraksi langsung dengan basa atau tulang punggung fosfodiester. Hasilnya mengungkap pola ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik, dan perubahan konformasi yang memungkinkan protein mencapai spesifisitas tinggi terhadap target asam nukleatnya. Pemahaman yang mendalam tentang mekanisme pengenalan ini sangat penting untuk rekayasa protein dengan afinitas dan spesifisitas yang ditingkatkan, serta untuk pengembangan strategi terapeutik yang menargetkan interaksi protein-asam nukleat yang menyimpang dalam penyakit seperti kanker dan infeksi virus.